Le chloroplaste est observable en microscopie photonique "in vivo" (observation vitale), mais sa structure ne peut être détaillée. La structure du chloroplaste a été par contre, très finement analysée en microscopie électronique à transmission sur sections ultrafines. Cette technique est simplement topographique. Il est nécessaire d'utiliser d'autres techniques complémentaires pour préciser la localisation des différents éléments fonctionnels.

	Cryofracture et cryodécapage		Coloration négative
	Immunocytochimie		Utilisation de mutants déficients
	Isolement des chloroplastes		Fractionnement de chloroplastes

Les techniques de fractionnement cellulaire (isolement des chloroplastes) ont permis d'étudier la physiologie du chloroplaste isolé. Des fractionnements plus poussés (isolement des thylacoïdes) ont permis de localiser les phases principales de la photosynthèse. Enfin des techniques fines de caractérisation (immunocytochimie) associées à des techniques de microscopie (cryodécapage, coloration négative) ont permis de localiser les différents éléments fonctionnels (photosystèmes, ATP-synthase,..).

Pour voir des exemples de structure :

• Chloroplastes des algues
• Chloroplaste des plantes supérieures