En aérobie, le pyruvate entre dans la mitochondrie où
il subit une décarboxylation et une oxydation combinée
en acétyl-CoA. Cette réaction irréversible est
catalysée par le complexe
multienzymatique de la pyruvate déshydrogénase composé
de trois enzymes (pyruvate déshydrogénase, dihydrolipoamide
transacétylase et dihydrolipoamide déshydrogénase)
et de cinq coenzymes (thiamine
pyrophosphate, acide
lipoïque, CoASH,
FAD
et NAD+).
Le groupement carboxyle du pyruvate est retiré sous forme d'une
molécule de CO2 alors que les deux autres carbones
restants deviennent le groupement acétyle de l'acétyl-CoA.
La réaction bilan est la suivante :
CH3COCOO- + CoASH + NAD+ ----------->
CH3COSCoA + NADH + CO2
Le NADH produit sera réoxydé par la chaîne
respiratoire et permettra la synthèse de trois ATP.
Le mécanisme de décarboxylation oxydative
peut-être décomposé en décarboxylation et
oxydation du pyruvate puis régénération de l'acide
lipoïque. L'animation suivante présente le rôle biochimique
des coenzymes et les transferts électroniques nécessaires
à la réalisation de ces étapes. Les positions relatives
des intermédiaires et des enzymes du complexe ne sont pas indiquées.
Afin de visualiser ce mécanisme, cliquez sur les chiffres en
dessous de l'animation.
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1- Etape de décarboxylation d'un acide alpha-cétonique
(coenzyme TPP). Cette étape est identique à celle
décrite lors de la fermentation
alcoolique.
2 et 3 - Etape d'oxydo-réduction (coenzyme
acide lipoïque). Oxydation du groupement hydroxyéthyl
(R = CH3) en une fonction thioester par réduction
du pont disulfure de l'acide lipoïque en deux groupements
thiols.
4- Etape de formation de l'acétyl-CoA (coenzyme
CoASH). Transfert du groupement acétyle de la fonction
thiol du dihydrolipoïque à la fonction thiol du CoASH.
5- Etape de régénération de l'acide
lipoïque (coenzymes FAD et NAD+) pour que le complexe
pyruvate déshydrogénase assure un nouveau cycle
catalytique. Le FAD réoxyde l'acide dihydrolipoïque.
Puis le FADH2 produit est réoxydé par
le NAD+, accepteur final des électrons.
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Ce mécanisme est identique quelque soit l'acide alpha-cétonique.
En particulier, on retrouve ce type de réaction, lors de la transformation
de l'α-cétoglutarate
en succinyl-CoA, dans le cycle de Krebs
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