La structure des chloroplastes est classique, mais chez les plantes d'ombre, les empilements de thylacoïdes granaires sont très importants et les thylacoïdes intergranaires beaucoup moins développés.

Une vue générale en microscopie électronique à transmission d'une portion de cellule chlorophyllienne de feuille d'arum. (Cliché : Christiane Tuquet)
Vue générale d'un chloroplaste. Remarquer l'importance des thylacoïdes granaires par rapport aux thylacoïdes intergranaires. (Cliché : Christiane Tuquet)	Détail d'un emplilement de thylacoïdes granaires. (Cliché : Christiane Tuquet)

Pour approfondir : les techniques d'étude, la structure des chloroplastes des algues, des plantes supérieures et leur différenciation.