La majeure partie du volume interne de l'oursin est occupée par le tube digestif et les gonades et par un important coelome ou "Cavité générale".
Cette cavité, à parois très fines, est compartimentée en cavités secondaires:
- cavité péri-pharyngienne avec extension aux branchies péri-orales
- poches dentaires, entourant les extrémités apicales des dents
- coelome péri-anal et péri-proctal
- coelomes inter- gonadiques et péri-gonoductes

L'une des fonctions de la cavité générale est d'assurer le maintien en place des gonades et du tube digestif. De ce fait, le volume de la cavité coelomique varie constamment, selon l'état de développement des gonades et du gonflement de l'intestin.