Les types de réactions simples rencontrés dans le catabolisme
sont principalement des réactions :
réaction
de simple transfert :
Il s'agit du transfert d'un groupement fonctionnel X
d'une molécule A sur une molécule B :
A-X + B ---> B-X
+ A
Ce type de réaction peut se décomposer thermodynamiquement
en une réaction d'hydrolyse et une réaction de condensation
avec un intermédiaire commun (X)
:
Réaction bilan: A-X
+ B ---> B-X + A
Le bilan global d'une réaction de simple transfert est exergonique.
Donc l'hydrolyse du donneur A-X
doit être suffisamment exergonique pour permettre la condensation
de X sur l'accepteur
B.
Le tableau suivant illustre le transfert d'un groupement phosphoryle
Pi
:
L'hydrolyse de composés phosphorylés à "haute
énergie" permet la synthèse d'ATP
à partir d'ADP
et de Pi,
de même, l'hydrolyse d'ATP permet la synthèse de composés
phosphorylés à "basse énergie".
Les réactions de simple transfert dans la glycolyse
et dans la dégradation des acides gras.
réaction
d'oxydo-réduction :
Une réaction d'oxydo-réduction est caractérisée
par un transfert d'électrons entre un réducteur 1 et un
oxydant 2 :
réducteur 1 ----> oxydant1 +
n électrons
n électrons + oxydant
2 ----> réducteur 2
Réaction bilan : réducteur 1 + oxydant 2 ----> oxydant
1 + réducteur 2
Dans le métabolisme, ces réactions font principalement
intervenir deux sortes de coenzymes : les couples NAD(P)+/NAD(P)H
et FAD/FADH2.
Les réactions d'oxydo-réduction dans la glycolyse,
le cycle de Krebs, la dégradation
des acides gras, la voie des pentoses
phosphates, la désamination
oxydative du glutamate...
réaction
de rupture/synthèse de squelette carboné
La réaction de rupture de squelette carboné concerne
les décarboxylations, les rétro-aldolisations et les cétolisations.
Elle permet d'obtenir des unités carbonées par différents
mécanismes qui ont tous en commun l'existence d'un puits électrophile.
Ces réactions dans la glycolyse (rétroaldolisation/condensation
de type aldolique), le cycle de Krebs (décarboxylations),
la voie des pentoses phosphates....
réaction
d'addition/élimination
Ce type de réaction aboutit à la saturation d'une double
liaison ou à la création d'une insaturation.
Les réactions d'addition/élimination dans la glycolyse, le cycle de Krebs,
la dégradation des acides gras
...
- réaction
d'isomérisation
Il s'agit du transfert de groupements à l'intérieur d'une
molécule donnant une forme isomère.
Les réactions d'isomérisation dans la glycolyse et dans la voie
des pentoses phosphates.
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