Dans la région postérieure de la tête, l'oreille interne s'ébauche sous forme d'une vésicule dérivée d'un épaississement de l'épiderme (placode otique).

Au niveau de l'endoderme, la cavité pharyngienne forme des diverticules latéraux: les poches viscérales, appelées à devenir les poches branchiales chez les vertébrés aquatiques.